瑞金医院并非交大医学院直属上海，而是附属医院。从临床来看，瑞金临床医学院始于1959年成立的医学系，设在原广慈医院，实行院系结合的教学管理体制，1995年医学系第一部分正式更名为瑞金临床医学院，设在上海交通大学医学院附属瑞金医院。

此外，上海交通大学依托瑞金医院百年文化底蕴，秉承 "质量立院、人才强院、科教兴院 "的办院方针，凭借雄厚的师资力量和强大的医疗实力，上海瑞金临床医学院为社会培养了一批又一批优秀毕业生。同时也培养了一大批在国内外享有较高声誉的医学专家。