北京东方医院和北京东直门医院不是一个医院，前者在北京市丰台区芳馨园一期6号，后者在北京市东城区海云仓5号。在临床上，它是北京 中医药大学第二临床医学院，国家中医药管理局直属单位，是三级甲等中医科 医院。

此外，北京东直门医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合性三级甲等中医医院，是国家中医临床研究基地，是国家食品药品监督管理局认定的国家药物临床试验机构，是首批国家中医医院示范、北京市医保定点医院。

北京东方医院擅长诊治的疾病很多，其中以脑病、心血管病、妇科病、肺病、脾胃病、护理为佳，分别有国家中医药管理局重点专科项目14项、 脑病科、周围血管病科、肾病科、心血管病科、妇科、眼科、肺病科、脾胃病科、儿科、皮肤科、耳鼻喉科、肿瘤科、护理部、预防保健科（治未病中心）。此外，还有牵头专科，其中五个是脑病科、心血管科、呼吸发热科、妇科和儿科。