上海长海医院是华东军区所属部队医院。1949年5月30日，上海市军事管制委员会任命项瑾同志为接管专员，接管国民党联勤部第二总医院，7月14日正式成立华东军医人民医学院附属医院。1953年4月前，医院建制隶属于华东军区后勤卫生部，1950年11月，医院更名为上海军医大学医院；1958年9月，因学校组建第二附属医院，故名第二军医大学第一附属医院.上海长海医院。

上海长海医院不是二级医院，而是三级医院。目前，上海长海医院占地面积23.4万平方米，建筑面积68万平方米，下辖1个中医部、57个科室，配置床位2100张，经过65年的建设和发展，已成为学科门类齐全、医疗特色鲜明、综合实力雄厚的现代化大型综合性医院。此外，医院还拥有1个国家临床医学研究中心、15个国家重点学科、5个卫生部临床重点专科、18个全军医学专科研究所等。与英国剑桥大学、加拿大麦吉尔大学、新加坡中央医院等20多个国家的著名医学机构建立了高水平的科技合作关系。该 医院 还与 20 多个国家的其他著名医学 机构 建立了高水平的科技合作关系。