北京空军将军医院距离北京西站、北京站较近。一般来说，患者可以从北京西站乘坐地铁9号线，经过2站，到达六里桥站，再乘坐地铁10号线，经过3站，到达西钓鱼台站，步行约790米，就可以到达空军总医院医院。此外，还可以从公主坟站下车，换乘40、368、724路，在钓鱼台站下车；或从万寿路站下车，换乘335路，在钓鱼台站下车；或从阜成门站下车，换乘121、335路，在钓鱼台站下车。

病友们也可以乘车前往北京空军大将医院 ，比如公交车，从香河总站乘坐938路空调车下行，在大北窑下车，再换乘37路上行，在马市庙下车，空军大将医院就在马市庙下车的位置。此外，还可以从香河客运站乘坐938路空调车下行，在梨园下车，然后换乘地铁八通线下行，在四惠东下车，再换乘地铁1号线下行，在南礼士路下车，最后换乘56路上行，在马神庙下车，空军总医院在马神庙下车地点下车。