海军专科医疗中心和长海医院都在上海市，这两所医院的环境、设施设备、医生临床经验都不错，但也存在一些差异，分析如下：

1、创建年份：中国人民解放军海军专科医疗中心创建于1954年12月，长海上海创建于1949年7月，创建年份相同；

2、地址： 海军专科医疗中心在上海长宁区淮海路338号，上海长海医院在上海杨浦区长海路168号；

3、专业科室： 海军专科医疗中心专科有外科、整形外科、肝胆外科、妇产科、生殖医学科等，上海长海医院专科有风湿免疫科、泌尿外科等。

通常，患者在选择医院时应遵循相应的规则，如小病及时到就近的社区医院就诊，大病选择二级以上医院，尽量选择大型三级医院或高校附属教学医院。另外，看病先挂普通号，看疑难杂症挂专家号，尽量选择副主任医师以上的。总之，患者可以通过官网查询医院或医师简介，包括职称、专业方向、擅长诊治哪些疾病、出诊时间等，然后选择适合自己的。

海军专科医疗中心与长海医院不是一个医院，前者在长宁区，后者在杨浦区。从临床来看，中国人民解放军海军专科医疗中心的前身上海市立济民医院教堂创建于解放后的华东军区空军，主要负责海军特种职业病的研究、预防、诊疗、应急支援保障等。此外，上海长海医院开始称为华东军区人民医学院附属医院，1951年7月更名为第二军医大学附属医院，1958年9月成立第二军医大学第一附属医院，经过65年的建设和发展，现已成为一所现代化的大型综合性医院。