上海长海医院属于军队系统的医疗单位，也是军级单位。在临床方面，上海长海医院于1999年荣获 "全国百佳医院 "称号，先后被评为全国 "支援西部地区医院工作先进单位"、全军 "思想政治建设先进单位"、"文化建设先进单位"、全军 "思想政治建设先进单位"、"文化建设先进单位"。"思想政治建设先进单位"、"医院文化建设先进单位"、"服务部队先进医院 "等荣誉称号。

此外，上海长海医院现有国家临床医学研究中心1个，国家重点学科15个，国家卫生部临床重点专科5个，军队医学专科研究所18个，重点实验室2个，军队或上海市护理示范基地10个，上海市重点学科1个等、 其中胰腺疾病与前列腺疾病诊疗团队入选 "全国教育科研院 胰腺疾病和前列腺疾病诊治团队入选 "国家教育部创新团队"。

上海长海医院不是国有企业，而是公立医院，属于事业单位。从临床来看，上海长海医院地处东海之滨、黄浦江畔，医院医疗服务特色鲜明，拥有亚洲一流水平的门急诊大楼、世界最先进的达芬奇手术机器人系统，是国家执业医师资格考试临床实践技能类考试基地、上海市住院医师规范化培训全科临床基地，全国、全军护理优质服务示范医院等，其门、急诊总诊疗人次首次突破300万，医疗发生额突破30亿，手术4.69万例，出院人数8.86万，平均住院日7. 8天。