北京空军总医院和空军专科医疗中心没有什么区别，这是一所医院，位于北京市海淀区阜成路西钓鱼台。从临床上看，北京空军总医院是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型现代化综合性三级甲等医院，承担着空军和联勤官兵的健康保障和疾病治疗。

此外，医院学科设置齐全，设有50多个临床、医技科室，拥有皮肤科、中西医骨伤科、中医科3个国家中医药管理局重点学科和专科、专病中心，1个军事皮肤病研究所，8个军事医学专科、专病中心，设有飞行学员医学选拔中心等一批特色学科。北京空军上将医院擅长皮肤科、骨科、泌尿外科、男科，其中骨科是最好的，该科室自建院以来，专业技术水平取得了很大的提高，逐步形成了以脊柱外科和关节外科为重点的骨科各项医疗技术全面发展的局面。此外，医院的皮肤科也不错，于 1980 年组建。现为国家中医药管理局中西医结合皮肤科重点学科、全军皮肤病研究所、国家卫生部药物临床研究基地、国家卫生部化妆品人体安全性和有效性试验机构及化妆品人体试验协作组组长单位。