北医三院和北京大学比较好，但二者不能相提并论，一个是医院，一个是学校。一般来说，北京大学第三医院是一所综合性的第三医院，医院有20个国家临床重点专科：骨科、药剂科、病理科、专科护理、检验科、消化内科、妇科、产科、职业病科等，而北京大学始建于1898年，初名京师大学堂，是中国近代第一所国立综合性大学。

北京大学的三医院北院区与北医三院直属院区有合作关系。从临床上讲，中国兵器工业集团北京北方医院是中国兵器工业集团公司直属医院，也是国家事业单位，原名522医院，1995年扩建后更名为中国兵器工业集团北京北方医院。目前，医院开展内科、外科、妇产科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、中医科、急诊科、药剂科、影像科、检验科、理疗科及预防保健、各种功能检查等业务。